Нужен ли регистр "Партии товаро организаций", если используется метод средневзвеешенной оценки, и нормально ли, что он заполняется в этом случае? При этом у меня он заполняется как-то выборочно.

он заполняется в любом случае - это нужно для того, если вдруг захотите вести по партиям и тогда в этом случае не нужно перепроводить все документы. Заполняется вроде при восстановлении последовательности