Думалось что туда пишется себестоимость проданных товаров. Но почему-то не пишется.

(0) так заставь писаться

Не сможешь заставить - Убеди!
Не получится - шантажируй плюшками! 1С любит заполнять таблицы всякой х-нёй, покажи, что ещё ещё одна пустая таблица для всякой х-ни.
В конце-концов, начинай распроводить документы и непосредственно удалять элементы справочников. Следи, при этом, чтобы сознания не теряла, иначе без толку будет и база похерена...