Есть документ. И два макета на печать. В модуле документа Функция ПечатьМакета1, в него добавила на код ,вывода второго макета. В итоге при нажатие на кнопку выводится только 1-ый макет

ТабДокумент = Новый ТабличныйДокумент;
Макет       = ПолучитьМакет("макет1");

.................................
Возврат ТабДокумент;
ТабДокумент = Новый ТабличныйДокумент;
Макет       = ПолучитьМакет("макет2");
,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,
Возврат ТабДокумент;

Вот эта команда:

Возврат ТабДокумент;

Возвращает управление в вызвавшую функцию.
Так что дальше код не выполняется.

а как написать?

во втором макете, данные берутся из регистра, не из документа

(0) убери
Возврат ТабДокумент;
ТабДокумент = Новый ТабличныйДокумент;

Если ..... подразумевает код формирования документа на основе макета, то можно попробовать первый возврат закоментировать, а вместо него вставить разрыв страницы.

т.е если убираю, сразу ругается , что не хватает реквизитов

Вторая часть работала отдельно (если всё от начала до первого возврата закоментировать) ?

сперва должна выходить первая часть, данные из документа, потом второй макет некоторые данные из регистра

(8) Нужно убедиться, что второй макет вообще работоспособен, так как есть подозрение, что он неправильно формируется (ошибки в коде).

Функция Печать1()
ТабДокумент = Новый ТабличныйДокумент;
Макет       = ПолучитьМакет("макет1");

.................................
Возврат ТабДокумент;
КонецФункции

Функция Печать2()
ТабДокумент = Новый ТабличныйДокумент;
Макет       = ПолучитьМакет("макет2");
,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,
Возврат ТабДокумент;
КонецФункции

Функция Печать()
Печать1();
Печать2();

а так?

(10) Только про Показать нужно не забыть - иначе - вы сформировали два документа, а результаты формирования отправили коту под хвост.