ВЫБРАТЬ
    РезервыОстаткиПолные.Номенклатура,
    РезервыОстаткиПолные.Качество,
    РезервыОстаткиПолные.Характеристика,
    ВЫБОР
        КОГДА РезервыОстаткиПолные.Заказ ССЫЛКА Документ.Счет
            ТОГДА РезервыОстаткиПолные.Заказ.Дата
        КОГДА РезервыОстаткиПолные.Заказ ССЫЛКА Документ.ВнутреннийРезерв
            ТОГДА РезервыОстаткиПолные.Заказ.Дата
    КОНЕЦ КАК ДатаЗаказа,
    ВЫБОР
        КОГДА РезервыОстаткиПолные.Заказ ССЫЛКА Документ.Счет
            ТОГДА РезервыОстаткиПолные.Заказ
        КОГДА РезервыОстаткиПолные.Заказ ССЫЛКА Документ.ВнутреннийРезерв
            ТОГДА РезервыОстаткиПолные.Заказ
    КОНЕЦ КАК Заказ,
    РезервыОстаткиПолные.Склад,
    РезервыОстаткиПолные.РезервОстаток
ИЗ
    РегистрНакопления.Резервы.Остатки(
            &МоментВремени,
            ВЫРАЗИТЬ(Заказ КАК Документ.Счет) В (&ВыбЗаказы)
                ИЛИ ВЫРАЗИТЬ(Заказ КАК Документ.ВнутреннийРезерв) В (&ВыбЗаказы)) КАК РезервыОстаткиПоЗаказу
        ЛЕВОЕ СОЕДИНЕНИЕ РегистрНакопления.Резервы.Остатки(&МоментВремени, ) КАК РезервыОстаткиПолные
        ПО РезервыОстаткиПоЗаказу.Номенклатура = РезервыОстаткиПолные.Номенклатура
            И РезервыОстаткиПоЗаказу.Качество = РезервыОстаткиПолные.Качество
            И РезервыОстаткиПоЗаказу.Характеристика = РезервыОстаткиПолные.Характеристика
            И РезервыОстаткиПоЗаказу.Склад = РезервыОстаткиПолные.Склад
УПОРЯДОЧИТЬ ПО
        ВЫБОР
        КОГДА РезервыОстаткиПолные.Заказ ССЫЛКА Документ.Счет
            ТОГДА РезервыОстаткиПолные.Заказ.МоментВремени
        КОГДА РезервыОстаткиПолные.Заказ ССЫЛКА Документ.ВнутреннийРезерв
            ТОГДА РезервыОстаткиПолные.Заказ.МоментВремени
        КОНЕЦ,
        РезервыОстаткиПолные.Номенклатура,
        РезервыОстаткиПолные.Качество,
        РезервыОстаткиПолные.Характеристика,
        РезервыОстаткиПолные.Склад
АВТОУПОРЯДОЧИВАНИЕ

Порядок измерений в РН     Резервы:
1)Заказ
2)Номенклатура
3)Качество
4)Характеристика
5)Склад

Заказ В (&ВыбЗаказы)

+(1) это тоже порадовало:

ВЫБОР
        КОГДА РезервыОстаткиПолные.Заказ ССЫЛКА Документ.Счет
            ТОГДА РезервыОстаткиПолные.Заказ.МоментВремени
        КОГДА РезервыОстаткиПолные.Заказ ССЫЛКА Документ.ВнутреннийРезерв
            ТОГДА РезервыОстаткиПолные.Заказ.МоментВремени
        КОНЕЦ

и это:

ВЫБОР
        КОГДА РезервыОстаткиПолные.Заказ ССЫЛКА Документ.Счет
            ТОГДА РезервыОстаткиПолные.Заказ.Дата
        КОГДА РезервыОстаткиПолные.Заказ ССЫЛКА Документ.ВнутреннийРезерв
            ТОГДА РезервыОстаткиПолные.Заказ.Дата
    КОНЕЦ КАК ДатаЗаказа,
    ВЫБОР
        КОГДА РезервыОстаткиПолные.Заказ ССЫЛКА Документ.Счет
            ТОГДА РезервыОстаткиПолные.Заказ
        КОГДА РезервыОстаткиПолные.Заказ ССЫЛКА Документ.ВнутреннийРезерв
            ТОГДА РезервыОстаткиПолные.Заказ
    КОНЕЦ КАК Заказ

человек упорно хочет когда-нибудь нулл ;)

(4) Подумаешь Null.
А в условии ГДЕ(РезервыОстаткиПолные.Заказ ССЫЛКА Документ.Счет)ИЛИ(езервыОстаткиПолные.Заказ ССЫЛКА Документ.ВнутреннийРезерв)
написать нельзя ?

(5) намекаешь на то, что он в ВыбЗаказы пихает все документы нужного типа?

>КАК РезервыОстаткиПоЗаказу
похоже, имеется в виду 1 (одна) конкретная ссылка. тогда призываю сравнение на равенство

(6) Ну, кто его знает, что он там пихает.
Я не очень понимаю, зачем для проверки делать "Выразить" - оно или там есть или нет.
Конечно, в ВыбЗаказы может быть всё, что угодно, то есть подозрение, что проще оттуда всё лишнее выкинуть, чем в запросе это проверять.