Бухгалтерия 2.0
Бухгалтер оформила документ поступление товаров и услуг с минусовыми знаками, при этом не формируется проводка по НДС Д19-К60

Как правильно оформить возврат поставщику услуги?

(0) Сейчас начнутся упражения в остроумии.

только модификацией кода
там условие НДС>0 жестко прописано в коде

корректировку поступления сделать?

вариантов масса. в вашем случае так тоже можно, с минусом. но только надо вручную дополнительно ндс восстановить.
если это предусмотрено в договоре с поставщиком, то можно сделать просто возврат поставщику. корректировка поступления это на крайняк

(1)  Оно то конечно так - формально минусовых счет фактур быть не должно - однако некоторые компании (осбенно это касается энергетиков например) страдают выставлением отрицательных документов - и воздействовать на них увы никак.
Моноплия однако-с.
Приходится извращаться.

Впрочем вариант (3)  может возможен.

Но промблема чаще всего именно в том что на руках счет-фактура с отрицательными суммами. Которую не является корректировкой (исправлением) к первоначальной.
А является именно перерасчетом услуги.

(0) а прямо в глаз: что за услугу ты мне предоставил? лови ответный пендель

по восстановлению ндс по поступлению в закрытом периоде просто на 60-ку его восстановить нельзя. по правилам это делается на 68.02 в книгу продаж

(2) Это мне подходит больше всего, не подскажите в какой процедуре искать?

Модуль объекта документа "ПостулпениеТоваровУслуг"

Процедура ДвиженияРегистровПодсистемыНДСБУ(СтруктураШапкиДокумента, СтрокаТаблицы, Содержание, Проводки, Отказ, Заголовок);

Если СтруктураШапкиДокумента.УчитыватьНДС И СтрокаТаблицы.НДС > 0 Тогда

Меняем на
    
    Если СтруктураШапкиДокумента.УчитыватьНДС И СтрокаТаблицы.НДС <> 0 Тогда //upd

(9) а точно, тоже нашел спасибо

а) операция - сторно
б) см.(3)
все прочее от лукавого

(3) корректировка поступления - идеальный возрват услуг