Система не разрешает печать накладных при минусовом остатке на складе -
при этом выдает сообщение "реализация превышает остаток". Возможно ли
разрешить печать с минусовым остатком, и как это сделать?

самое простое - разрешить отрицательные остатки

"Система не разрешает печать накладных при минусовом остатке на складе" - чего-чего? О_О

(2) Перед печатью идёт проведение наверняка. А непроведённые печатать нельзя

(3) Это бы я понял. Но в (0) жеж про проведение ни слова.

(4) в (0) есть слово УТ11...

Не помню про УТ(-г), но в БП есть галочка "Разрешается списание запасов при отсутствии остатков по данным учета".