Подскажите : вроде  в Доп правах пользователя не стоит "Разрешить превышение остатка товаров организации" и не стоит "Разрешить превышение остатка товаров на складе" а все равно дает списать в минус , где галку ставить?

Это РАУЗ - нигде.

контроль работает при оперативном проведении

(2) Нет !

(3) ты бредишь
в оперативном режиме и при неполных правах контроль минусов по складу в КА, УПП и УТ 10.3 работает

А еще печалька в том что в договоре стоит "По документам растовов с контрагентами" а в измерение ссылку не записывает

(3) может у тебя еще использован регистр "свободные остатки"

(5) в какой Рг ?

(4) так секрет в полных правах?

(8) тебе что-то мешает открыть конфигуратор и позырить ?

(7) и взаиморасчеты , расчеты с контрагентами .... там где есть "сделка"

(9) в КА как раз к августу разрою

(10) а каким боком это имеет отношение к "По документам растовов с контрагентами" ?
в сделки пишется, когда договор по заказам

(12) т.е нельзя что бы было По договору в целом .... а что тогда по докуменам расчета?

(13) книжки читай
топик закрыт

(14) как то грубо....

(13) это когда автоматический зачет не работает - надо ручками прописывать документы расчета

Еще Можно?
Включил партионный учет, перепровел документы, поступление по партиям движения делает , а реализация нет...

Смотри учетную политику, чо.

Вангую сходу: галка "списание партий расходными ордерами"?