Конфигурация УПП 1.3 нужна страна происхождения номенклатуры, в карточке номенклатуры есть реквизит "Страна" который появляется, только если указана галочка ввести по сериям. Так таковы серии не всегда нужны. и вот вопрос: Если указывать для всей номенклатуры, всегда вести учет по сериям и заполнять только страну в карточке а сами серии не использовать в документах(оставлять пусто), чем это может обернуться и какие последствия могут быть и стоит так делать?

В каком-нибудь документе может быть проверка, что серия не пустая, если включен учет по сериям.

Создай серию просто с наименованием страны и все, остальные реквизиты оставь пустыми

Групповой обработкой заполнить Страну в справочнике номенклатуры ( без контроля при записи), не обязательно же менять форму ;) (ну или написать свою обработку)