Есть ли какая-либо программа (типа monitor от аладдина) которая покажет в сети сколько есть всего мест и сколько израсходовано лицензий?
база файловая.

программные лицензии ставятся локально на машины. Сетевых не бывает

то есть к примеру 6 компов в сетке. Поставили на 5 компов, а 6-й тогда не будет работать, даже если на этих 5ти не запущен 1с?

(2) Будет. Ставь туда где установлен сервер 1с или на рдп