(0) А на кой тебе .Активная, это судя по всему у тебя булевый реквизит. Полагаю надо так:
Запрос = Новый Запрос;
Запрос.Текст =
"ВЫБРАТЬ
|Спецификации.Ссылка КАК Спецификация
|ИЗ Справочник.СпецификацииНоменклатуры КАК Спецификации
|ГДЕ Спецификация.Активная И Спецификации.НОменклатура = &Номенклатура";
И там уже Выборкой доставать нужную спецификацию...