Может у кого есть готовое? Нужно получить список товаров которые не привязаны к группе товаров на сайте. Или хотя бы в какую сторону копать?

вверх

не, ну а вдруг

Что в вашем понимании "не привязаны к группе товаров на сайте"?

Насколько я поняла есть потребность сравнить данные сайта с данными базы, для этого сайт должен данные отдать каким-то образом.
Если речь идет о разовой сверке, то в админке сайта есть возможность вывести списку товаров дополнительные поля, а затем выгрузить список в Excel.
Скорее всего потребуется помощь разработчиков сайта.
Можно запросить у них формирование  например отчета с идентификаторами, который вы загрузите в базу и там сравните.

(0) "Группе товаров на сайте" - это как? В каталогах Битрикса есть понятие "Товар" и "Раздел".

я говорю про дерево групп http://savepic.org/6010888.png
-----------
нужно получить список товаров 1с которые не включеным в дерево

Грохнуть все и по новой выгрузить. :-)

кого грохнуть -то ?
товар заводится новый в 1с
как отследить что ему группу на сайте не забыли назначить?

вот лентии все )

(8) Кто лентяи? Мы с самого начала написали свою выгрузку/загрузку и теперь товары у нас автоматом к сайту привязываются. А если вдруг кто-то не привяжется по какой-то причине, их видно в отчете на сайте: php дергает 1С через веб-сервис и все в табличке красиво показывает.