Надо написать отчет с колонками:
  Реализация - Задолженность - ПросроченаняЗадолженность
  В конфигурации движения документов только по региструБухгалтерии.
  План счетов очень похож на тот , который в типовой бухгалтерии.

  Реализация заносится в Субконто 3 при прведении реализации и документа оплаты.

  Правильно ли считать , что Остаток по 62.01 и субконто3 = реализация
это задолженность по данной отгрузке ?
  Какую виртуальную таблицу регистра бухгалтерии лучше использовать ?

Переходите на БП 3.0, там это реализовано

(1) Увы. Такой задачи не поставлено и времени не отведено.

Да правильно в свое время реализовывал.Только нужно учесть что оплаты должны будут вводится с документом расчетов для того чтобы закрывался 62 по 3 субконто

А какую таблицу лучше использовать ?

(4) Остатки.