Скорее всего у тебя вот это:
Для файлового режима работы в настройках системы (обычно Сервис - Настройка параметров учета) должен быть указан пользователь для выполнения регламентных заданий и интервал опроса. Под этим пользователем нужно держать дополнительный запущенный сеанс 1С:Предприятие, который будет выступать в роли планировщика для запуска заданий.
Требовать и эффективности, и гибкости от одной и той же программы — все равно, что искать очаровательную и скромную жену... по-видимому, нам следует остановиться на чем-то одном из двух. Фредерик Брукс-младший