В 1С с помощью встроенных объектов (WSПрокси, ФабрикаXDTO и т.д.) реализован вызов методов сторонних веб-сервисов, а можно ли получить запрос и ответное сообщение в виде xml?

Ты хочешь перехватить вызов который уходит из 1С?

(1) Да, и тот, который приходит в 1С

(2) Ну тот то который приходит тебе никто не мешает перехватить. Ты ж его получаешь в качестве возврата после вызова метода вебсервиса.
А тот что уходит, не совсем понятно зачем. Тебе и так все известно в нем.

Фиддлер тебе в помощь

(3)>>Ты ж его получаешь в качестве возврата после вызова метода вебсервиса.

Вот например вызываю метод, который по сути процедура (ничего не возвращает, содержит только выходные параметры):

Прокси.CreateDocumentWMHS(<бла-бла>);

Как отсюда получить ответ?

(3) >>А тот что уходит, не совсем понятно зачем. Тебе и так все известно в нем.
Делаю логгирование обмена со сторонней ИС, проще сохранять запрос и ответ (и потом их глазами смотреть в случае разбирательств), чем городить огород с сохранением списка входящих и исходящих параметров вызываемых методов

(4) С таким же успехом обычно использую SoapUI, но в данном случае нужно именно встроенное

(6) Или перехватывать снифером или использовать HTTP-сервисы в 8.3. Как бы ты не пытался получить исходный XML-текста запросе 1Совского веб-сервиса, ты все равно не получишь "чистый" текст XML-пакета.