Юзер разваричвает окно, работает, а завтра после запуска винды опять окна становятся свернутыми.
Это после установки севен, а при ХР такого не было говорит.
Есть возможность настроит?

поставь ХП

выйти правильно сначало из 1с потом из сеанса

(1) безнадега?

(3) смотри (2)

(2) + закрыть в 1С по очереди все открытые окна и завершить сеанс работы 1С должно помочь решить проблему. Иначе - почистить кеши 1С на компе пользователя (если локальный режим).