В результате запроса получил табличку вида
Дата |  Магазины  |  Выручка  |

Пользователь желает

Дата  |  Магазин1 |  Магазин2  |  Магазин2  |  Магазин...|

Можно ли данное преобразование сделать запросом?

Уточни какое именно преобразование? Если ты имеешь ввиду выбрать данные из разных таблиц то нужно их связать (таблицы) или перестроить запрос. Если ты имеешь ввиду работу с запросом в пользовательском режиме, то если данных в о магазине2 и магазине3 в конфигураторе поля не добавлены то в режиме 1С предприятие ты не увидишь.

(0) Есть такая замечательная штука - СКД называется. Там можно так сделать.
"Чисто" запросом, без "извратов" - не получится.

А можно создать программно- управляемый запрос который в зависимости от условия будет выбирать одни данные, если условие соблюдается, а если не соблюдается то будут выбираться другие данные Я с этим сегодня на работе столкнулся У меня тупо запрос ничего не выбирает если не указаны банковские реквизиты, а если указаны выбирает, мне пришлось обходится во втором случае простой выборкой данных из документа, а я хотел бы это сделать в одном запросе.

На клюшке делается в полпинка псевдоштатным образом
Чем я пользуюсь и не морочусь с выводом
Главное собрать правильную линейную плоскую таблицу
Дата магазин выручка

Осталось объяснить что такое клюшка что бы поняли все.

(0) а вообще, клюшки - это хорошо:
1. легко
2. просто
3. надежно
4. дешево
...

Ана восьмерке как это сделать?

(0) Можно - кросстаблица на скд

(0) ну так соедини свой результат с табличкой магазинов столько раз сколько у тя там магазинов и юнион потом