"ВЫБРАТЬ
    |    ТоварыОстатки.Номенклатура КАК Номенклатура,
    |    ТоварыОстатки.КвоОстаток,
    |    ЦеныНоменклатурыСрезПоследних.Цена,
    |    ТоварыОстатки.Номенклатура.Код,
    |    ТоварыОстатки.Номенклатура.Производитель
    |ИЗ
    |    РегистрНакопления.Товары.Остатки КАК ТоварыОстатки
    |        ПОЛНОЕ СОЕДИНЕНИЕ РегистрСведений.ЦеныНоменклатуры.СрезПоследних(, ) КАК ЦеныНоменклатурыСрезПоследних
    |        ПО ТоварыОстатки.Номенклатура = ЦеныНоменклатурыСрезПоследних.Номенклатура"
    ;

Нужно выводить товары те на которые есть остаток и нет цены, и те на которые есть цена нет остатка.
Если запрос сделать как я написал, получится что для тех товаров, где есть цена но нет остатка, поля "Номенклатура", "Код", "Артикул" - пустые.

Как правильно сделать запрос, чтобы эти поля в любом случае были доступны?

(0) соединить справочник налево с остатками

Тоесть сделать два левых соединения : справочник с остатками и справочник с ценами. И отобрать по условию где цена больше нуля или остаток больше нуля. Так?

есть null

цены = 0 такое бывает? :)))

продаешь по нулевой цене :)

(5) число прайс-листов на предприятие может перевалить за сотню и ни один товар не входит во все прайсы

(0)с таким стажем стыдно должно быть задавать такие вопросы...

соединение вирт. таблиц - не есть хорошо.