При перегрузке документа "Отражение зарплаты в рег. учете" в бухгалтерии по каой-то причине субконто "подразделение" остается пустым, в субконто "номенклатурная группа" записывается подразделение, а в субконто "статьи затрат" записывается номенклатурная группа. Т.е проводка формируется как бы со смещением.
Если кому интересно, то набрел на обсуждение здесь http://forum.infostart.ru/forum8/topic81904/ там предложили сделать перегрузку из бухгалтерии в ЗП, я отметил Только "План счетов" и "Виды субконто".
После загрузки в ЗУП переформировал "Отражение ЗП в рег. учете" и загрузил его в бухгалтерию после чего проводки стали верными.
Не знаю в чем тут дело, но предполагаю, что проблема была в несовпадении кодов плана счетов или видов субконто т.к. до этого данные выгружались в 1с БУХ 7.7
Независимо от того, куда вы едете — это в гору и против ветра!