Тупо не пойму как сохранить изменения:
    Запрос = Новый Запрос;
    Запрос.Текст = "ВЫБРАТЬ
                   |    ДоговорыКонтрагентов.Код КАК Код
                   |ИЗ
                   |    Справочник.ДоговорыКонтрагентов КАК ДоговорыКонтрагентов
                   |ГДЕ
                   |    ДоговорыКонтрагентов.Организация <> &НужнаяОрганизация"       ;
                  
    Запрос.УстановитьПараметр("НужнаяОрганизация", Справочники.Организации.НайтиПоНаименованию(    "ИП ****** Е.В."));
    Результат = Запрос.Выполнить().Выбрать();
    Пока Результат.Следующий() ЦИКЛ
         Справочники.ДоговорыКонтрагентов.НайтиПоКоду(Результат.Код).ПолучитьОбъект().Организация = Справочники.Организации.НайтиПоНаименованию("ИП *** Е.В.");
            
//----Это не работает --->>>>>>>          Справочники.ДоговорыКонтрагентов.записать();
    
    КонецЦикла;

ИП___ЕВ = Справочники.Организации.НайтиПоНаименованию("ИП *** Е.В.");
   Запрос = Новый Запрос;
    Запрос.Текст = "ВЫБРАТЬ
                   |    ДоговорыКонтрагентов.Ссылка
                   |ИЗ
                   |    Справочник.ДоговорыКонтрагентов КАК ДоговорыКонтрагентов
                   |ГДЕ
                   |    ДоговорыКонтрагентов.Организация <> &НужнаяОрганизация"       ;
                  
    Запрос.УстановитьПараметр("НужнаяОрганизация",ИП__ЕВ);
    Выборка = Запрос.Выполнить().Выбрать();
    Пока Выборка.Следующий() ЦИКЛ
        Обж = Выборка.Ссылка.ПолучитьОбъект();
        Обж.Организация  = ИП__ЕВ;
        Обж.Записать();
    КонецЦикла;

мда...

Лефмихалыч, а чего я не так сделал в данном случае?

(3) да всё!

я предельно не понимаю ни фига. Даешь человеку готовый код, в котором написано, как правильно, супротив того неправильного, что у него есть. И - фигак -вопрос такой на засыпку: "Лефмихалыч, а чо не так?"
ну вот то, что отличается от (1), то и не так, ёптыть! Очевидно же!..

Готовый код - это рыбка(Спасибо) , просто заинтересован в сборке удочки.

(6) в 1С нельзя стримить. То есть конструкции вида Одно.Другое().Третье().Четвертное().Пятое() не живут в общем случае. ПОлучил объект - сохрани в переменной и с ней работай.

+(7) и любые НайтиПо*() внутри цикла использовать нельзя, равно как и чтоТО.ЧтоТО.ЧТоЛибоЕще - получение реквизитов от реквизитов. Ибо это запрос в цикле. У программистов 1С от такого шерсть на ладошках вырастает и слепоглазие

(7)А я то думаю, что это за зуд такой появился в ладошках... И временами резкость теряется. ;)

(0) ...//----Это не работает --->>>>>>>          Справочники.ДоговорыКонтрагентов.записать();

Весь справочник записывать собрался.
И как это должно работать, по твоему мнению?

Ни как не могёт работать.
Возникла другая заморочка: когда в модуле справочника отрабатывает процедура "перед записью", то получаю отказ.
{Существуют документы, проведенные по договору "Договор №ПЕ29...}.
Как  быть? 1. а) Запомнить где нибудь, какие документы были проведены, б) затем распровести их, изменить справочник, в)а потом пос списку из "а)" провести заново.
2. Временно отключить проверку в справочнике.

п.1

В этой же процедуре создать структуру или временную таблицу?

Туплю. Можно сохранить в Выборке список проведенных доков

п2. Объект.Спр.ОбменДанными.Загрузка = Истина :)

ПерваяТочка лишняя подразумевалось ОбъектСпр