воткнул флешку в хостовый комп, что-то на неё скопировал

запускаю гостевую ОС под ubuntu-14.04.2-desktop-amd64
туда монтирую флешку
она появляется в гостевой ОС, а в хостовой исчезает

как сделать, чтобы она не исчезала из хостовой ОС ?

Монтируй не флешку как USB-устройство, а публикуй путь к флешке как общую папку.

(1) одновременно нельзя так монтировать ?

(2) Думаю, это невозможно теоретически. USB это протокол точка-точка с установлением соединения.

(3) как же тогда usb мышь работает и в хостовой ОС, и в гостевой ?

(4) Мышь не как устройство, а как драйвер работает. Но некоторые устройства USB умеют клонироваться. Ключи USB к примеру... Но Vbox - это не умеет.

(5) т.е. это от виртуальных машин зависит ?
какие умеют ?

(6) Умеют что? Пробрасывать ЛЮБОЕ USB устройство по-моему нигде нельзя. Мышь работает через специальный драйвер, внутри виртуальной машины видно не физическое устройство, а виртуальное.

http://www.virtualhere.com/
Умеет. Не любое.

В смысле не пробрасывать, а виртуализовывать, наоборот. Логически USB-клиент может быть подключен только к одному хосту одновременно.

Но бывают коллизии, нельзя одновременно запрос слать к устройству.

(8) но сервер там только под линем ?

(11)  На сколько я знаю, да.

Виртуалки какие умеют ?

(13) Никакие. (8) решает совсем другую задачу, а не вашу.

(14) какие ВМ умею клонировать усб-устройства ?

(15) В вашем смысле - никакие. Возможна лишь эмуляция определенных устройств, как это сделано с мышкой - и в этом случае абсолютно без разницы, какая мышка на хосте, ps/2 или usb.

(16) какие вм умеют клонировать юсб ключи ?