Боже, это же адовый капец.... Научу специалистов 1С корректному анализу аргументов командной строки. В общем заработало. Надо только параметр --report ставить раньше всех. Что за дебилы...
Вроде всё и так работает.
Описать корректно список шаблонов источников информации и запустить, указать путь и файл для etalon и report.
Судя по твоей строке "--etalon="c:\!\" , файл не должен был быть создан, написал бы "Ошибка доступа к файлу".
Закон Брукера: Даже маленькая практика стоит большой теории.