ШК = ОткрытьФормуМодально("Обработка.123.Форма.РегистрацияШК",,ЭтаФорма);

У формы РегистрацияШК Стоит свойство Блокировать окно владельца

Проблема ОбработкаОповещения срабатывает во и в основной форме и в РегистрацияШК.