Когда в группировке вывожу регистратор, остатки на начало и конец стают бредовыми, вот сам запрос:

ВЫБРАТЬ
    "Взаиморасчеты по визиту" КАК ВидВзаиморасчетов,
    ВзаиморасчетыПоВизитуОстаткиИОбороты.Организация,
    ВзаиморасчетыПоВизитуОстаткиИОбороты.Регистратор,
    ВзаиморасчетыПоВизитуОстаткиИОбороты.СуммаПриход,
    ВзаиморасчетыПоВизитуОстаткиИОбороты.СуммаРасход,
    ВзаиморасчетыПоВизитуОстаткиИОбороты.СуммаНачальныйОстаток,
    ВзаиморасчетыПоВизитуОстаткиИОбороты.СуммаКонечныйОстаток
ИЗ
    РегистрНакопления.ВзаиморасчетыПоВизиту.ОстаткиИОбороты(&НачалоПериода, &КонецПериода, Авто, ДвиженияИГраницыПериода, ) КАК ВзаиморасчетыПоВизитуОстаткиИОбороты

Роль у поля НачальныйОстаток - НачОст, Сумма;
Роль у поля КонечныйОстаток - КонОст, Сумма;
Роль у поля Регистратор - Период, 1;

Как правильно выводить остатки?

отчет я так понимаю на СКД?
добавь в поля запроса Период

Периодичность укажи явно  по регистратору, может поможет

(1) Да, на скд

(1) Спс, помогло