Планируется организовать центральную базу и несколько филиалов. Отчетность будет сдаваться из центральной базы. Вопрос такой: как-то можно будет увидеть отчетность каждого обособленного филиала отдельно ? То есть главбухи в каждом филиале должны видеть свою декларацию по НДС, по прибыли и т.д. И чем отличается БП проф от БП корп?

По моему можно будет. (Ну, елси планы обмена не переписаны.)
БП проф от БП корп? - в корп учет по ОП можно вести.

Как то так....

(0) Отличие БП-КОРП от БП :
Обособленные поддерживаются с выделением на баланс.
Установлен разделитель учета по Подразделениям.
Есть в типовых документах Авизо (несколько разных видов)
И типовые документы поддерживают регистрацию движений между обособленными подразделениями.

В КОРП Есть план обмена РИБ По организации.
Планов обмена по Подразделению почему-то нет. Я для подразделений обмен писал свой - с заменой реквизита Организация на реквизит Подразделение.