База на сервере. Захожу на прямую в конфигуратор - в свойствах конфы версия 2.5.90.3.

Захожу в туже самою базу через рдп - в свойствах конфы версия 2.5.88.1

Что за Х*ня?

И само собой если через рдп заходишь в пользовательский режим отрабатывает функция -
Функция ПроверитьЛегальностьПолученияОбновления(Знач ТекущаяВерсияИБ)

Глюк конкретно у одного пользователя, у которого нет прав обновлять конфу.

И открывает окно проверки легальности получения обновления.

кэш протух

почисти кеш

чисти карму

(1) (2) СПС реально кеш протух! я уж паниковать начал.

Чаще молись!

Давно пора бы уже запомнить что в любой непонятной ситуации надо чистить кеш:)