С управляемым интерфейсом толком не работал. Просьба сильно не ругать. Можно ли сделать чтобы список отчетов отображался не свернуто, в панели действий "отчеты", а по отдельности?

Можно.

При создании конфы с нуля отчеты помещаются в панель функций текущего раздела в виде меню. В то время как, например справочники помещаются на этой же панели раздельно. Как-то можно влиять из конфигуратора на способ отображения элементов в интерфейсе (такси)?