ЗУП для РК. Регистр расчета.Средний заработок. Неправильно рассчитывается база.

ЗУП для Казахстана. Редакция 1.1
Сильно переработаная и поэтому обновляемая ручным переносом явных изменений.
Есть база хорошо работала до 25 июня.
Произошло следующее 26 июня дела чистку и обслуживание базы.
1. Удаления помеченных объектов - частично без контроля
2. Тестирование и исправление. (со всеми галками)
Это было давно, пару недель назад. Восстановить из архива не предлагать.
На данный момент.
При расчете отпускных и больничных, при расчете среднего заработка происходит неправильный расчет.
Выяснил, в расчетную базу для среднего заработка идут все начисления, а не только те, что указаны как базовые для среднего заработка.

Провел эксперимент.
В план вида расчет "Средний заработок" удалил все базовые начисления. Оставил только "оклад".
При расчете все равно берет все начисления, как будто бы они все указаны как базовые.

Нашел кусок кода где это происходит. там запрос к
РегистрРасчета.РасчетСреднегоЗаработка.БазаДополнительныеНачисленияРаботниковОрганизаций
и
РегистрРасчета.РасчетСреднегоЗаработка.БазаОсновныеНачисленияРаботниковОрганизаций

Есть архив до 25 числа (до удаления и тестирования и исправления) И текущая база.
Сравнил результаты запроса к этим регистрам (при одинаковых вводных параметрах).
Результаты разные.

Тестирование и исправление делал- не помогает.
В файловом режиме и в серверном режиме - ни как не влияет, те же расхождения.

Такое ощущение ,что в регистр расчета Среднего заработка как-то прописались ВСЕ начисления, как базовые.
Или Пустые начисления, или начисления NULL.

Кто сталкивался подскажите, куда копать?