Формирую отчет на скд с использование внешнего источника. Собствено код из процедуре ПриКомпоновкеРезультата:
    ВнешниеНаборыДанных = Новый Структура;
    ВнешниеНаборыДанных.Вставить("ТаблицаЗначений", ТаблицаЗначений);
    
    ДанныеРасшифровкиСКД = Новый ДанныеРасшифровкиКомпоновкиДанных;
    
    СхемаКомпоновкиДанных = ПолучитьМакет("Макет");
    Настройки = СхемаКомпоновкиДанных.НастройкиПоУмолчанию;
    
    КомпоновщикМакета = Новый КомпоновщикМакетаКомпоновкиДанных;
    МакетКомпоновки = КомпоновщикМакета.Выполнить(СхемаКомпоновкиДанных, Настройки, ДанныеРасшифровкиСКД);
    
    ПроцессорКомпоновкиДанных = Новый ПроцессорКомпоновкиДанных;
    ПроцессорКомпоновкиДанных.Инициализировать(МакетКомпоновки, ВнешниеНаборыДанных, ДанныеРасшифровкиСКД,Истина);
    
    //ТабДок = Новый ТабличныйДокумент;
    ПроцессорВывода = Новый ПроцессорВыводаРезультатаКомпоновкиДанныхВТабличныйДокумент;
    ПроцессорВывода.УстановитьДокумент(ДокументРезультат);
    ПроцессорВывода.Вывести(ПроцессорКомпоновкиДанных);

Отчет работает, но почему то игнорит отборы добавленные в пользовательском режиме

(0) А где ты эти пользователькие настройки передаешь в СКД?
Вижу только использование СхемаКомпоновкиДанных.НастройкиПоУмолчанию

(1) Можеш пример привести? Гугл ничего внятного не выдал

(2) С СКД почти не работал, но видимо, надо брать не СхемаКомпоновкиДанных.НастройкиПоУмолчанию
а пользовательские - где они у тебя задаются? Наверняка в компоновщике, отборы которые выведены на форму.

(2) из коллекции пользовательских настроек на форме нужно перенести отборы в коллекцию пользовательских настроек настройку по умолчанию, которую ты получаешь из схемы

Настройки = КомпоновщикНастроек.Настройки;

Всем спасибо, помог ответ (5)