Подскажите, пожалуйста, как построить отчет по использованию рабочего времени по предприятию? Нужно посмотреть, сколько часов за произвольный период было отработано, сколько часов сотрудники провели в командировках, отпусках, исполняли гособязанности, сколько часов были в прогулах и так далее.

свод начисленной зарплаты и анализ начислений

(1) Это не то. Нам нужно посмотреть, например, сколько часов за месяц сотрудники были в командировках, сколько в прогулах. Свод этого не покажет.

Табель?

Такого отчета в "1С: ЗиУП 2.5" нет.
Рекомендую искать такой доп. отчет на одном известном добром сайте, где добрые люди выкладывают свои добрые разработки за  условные "$m" или рубли.

(3) Нет, нужно сводно, по предприятию, в удобочитаемом виде.