Добрый день!
Подскажите с запросом. Есть справочник с ограниченой иерархией ( в 2 элемента) у элемента есть флаг(Булево).Как запросом выбрать группы, где все элементы отмечены флагом?

(0) находишь все , имеющие хотя бы один не помеченный и соединяешь налево

Как-то так:
ВЫБРАТЬ
  Номенклутара.Родитель,
  МИНИМУМ(Номенклутара.Флажок) Мин
ПОМЕСТИТЬ ВремТЗ
Из Справочник.Номенклатура как Номенклатура;

Выбрать
  ВремТЗ.Родитель
ИЗ ВремТЗ как ВремТЗ
ГДЕ
  ВремТЗ.Мин = ИСТИНА

ВЫБРАТЬ
Спр.Родитель
ИЗ
Справочник.Спр КАК Спр
ПОМЕСТИТЬ Родители
ГДЕ
НЕ Спр.ЭтоГруппа И НЕ Спр.Флажок
;
ВЫБРАТЬ
Спр.Ссылка
ИЗ
Справочник.Спр КАК Спр
ЛЕВОЕ СОЕДИНЕНИЕ Родители
ПО Спр.ЭтоГруппа И Спр.Ссылка = Родители.Родитель
ГДЕ Родители = NULL

уже написали, плясать надо от группировки по родителю с функцией максимум и минимум на булевый реквизит

если результат функций истина, то все флажки проставлены