гружу из 3 разных баз ЗУП в УПП данные об организациях , при загрузке данных из 2-ой базы почему-то заменяется один элемент справочника, коды разные . что м.б. ?

Не может быть, а точно есть - такие правила.

да, поиск по коду стоит , правило сам создал в конфе , остальные нормально перегружаются всего в каждой базе по несколько организаций, все разные

Главное - никогда!!! Ты слышишь - НИКОГДА!!! не смотри в правила поиска...

(3) по коду стоит поиск :)

внутренний уид походу совпадет , а как изменить уид у элемента

УникальныйИдентификатор()

(4) проверь стоит ли галка в ПКО поиска по внутреннему идентификатору. И если выгружаешь через стандартный обмен, то еще проверить заполнение РС "Соответствие объектов для обмена" (как-то так)

спасибо