Экономисты ведут ШР в программе, в том числе и надбавки.
А программа может просто взять и начислить сотруднику надбавку, хотя приказа на нее нет. Вот топик по этой теме: v8: ЗУП Штатное расписание
Все какое есть решение, чтобы отключить данный функционал, необходимо, чтобы начислялись только те надбавки на которые есть приказ.
В отладчик пока не лазил, может тут, кто уже решил, времени нет (

Заранее спасибо.

зачем там отладчик?
эт же РС... заходишь в модуль объекта и комментишь код...

(0) Уберите надбавки из ШР.
Заведите надбавки через "Ввод сведений о плановых начислениях сотрудников организаций"

(0) странные у Вас экономисты... Если надбавка положена по штатке, то какие еще приказы должны быть? если эти надбавки зависят от стажа, то настройте их правильно. А если штатное расписание само по себе, то сделайте дублирующие должности и подразделения, и пусть они ими играются как хотят.