Здарова почаны.

Все мы с вами знаем что такое БП, да?

В договоре можно указать срок оплаты, если срок нарушен идёт задолженность.

НО!
Появился заказчик у нашего предприятия, у заказчика в договоре ДВЕ даты оплаты.

Первая дата оплаты 60 дней 50%
Вторая дата до конца 2016 года

Вопрос: как это реализовать в 1С ? Какую дату ставить

Переходи на ерп

(1) что, куда? вы шо таке.

Из за 1 человека куда то переходить? Тут БП стоит уже лет 6

а хоть бы и в допреквизиты

Пиши более позднюю, остальное считайте ручками