В обработке создаю документ Excel. Работаю с Excel через COM(1C 8.3). Есть код макроса который нужно выполнить. Как это сделать? Нужно, чтобы макрос уже был создан и записан в Excel?

Нет.
Просто выполняй код. Примеров в сети навалом.