обмен из периферийной в основною по полному плану обмена вывалился с ошибкой, не уникальный индекс документа...

смотрю в таблицах БД нахожу строки табличной части документа, самого документа нет. получается, что был обмен, загрузились только строки, при повторной загрузке вываливается ошибка, сам документ не создается, как такое может быть?

кривой обмен, там что хочешь может быть

(0) "нахожу строки табличной части документа, самого документа нет" - если действительно так - удалить эти строки из БД.

Сделай запрос для проверки:

Выбрать
* из
Документ.ТвойДок.ТабЧасть КАК ТабЧасть
Где ТабЧасть.Ссылка.Номер есть Null

(0) странно что в основной базе для РИБ обмена установлена проверка на уникальность номеров. Это же неправильно.
У нас такая проверка есть только при получении данных от касс в магазин , но нет такой проверки из магазинов в общую.
Имхо , неправильно установленная проверка - причина проблем.
Не должно быть каких либо препятствий для поступления документов в общую базу.

(2) удалить их можно и тестированием, я не могу понять, как вообще загрузились строки без документа

(3) Не путайте, пожалуйста, "уникальность номера" и "уникальность индекса" - это две большие разности :)
ТИИ, короче, светит ТС для поиска записи, порождающей неуникальный индекс и устранения ошибки в базе.

(4) Битые данные - они и в Африке битые.

(5) я был невнимателен. Спасибо.

(2) Средствами 1С выявить можно, но удалить - нельзя. Только после воссоздания самого объекта битой ссылки, можно будет получить доступ для удаления записей ТЧ такого документа.

PS: не уникальность индекса - это не обязательно битые данные. Битыми бывают не только данные, но и сами индексы. Переиндексация - и только тогда можно говорить более-менее уверенно о битых данных.