В общем перенес Партнеров и Контрагентов.
Но есть справочник Партнеры(Клиенты) в которым партнеры не видны.
При этом если перезаписать перенесенного партнера он там появляется.
Что это за связь и где мнее ее искать?

покупатель = истина?

(1) Клиент = истина

перед записью сравнить все что в Объект и Объект.Ссылка

в коде искать предлагали?

(4) ну я посмотрел куда там записывает справочник Партнеры при записи, перед записью. В один регистр он пишет. Но если он и влияет на что то, то не на мою проблему.

Надо смотреть функциональные опции. У меня что-то такое было когда переносил в УТ11 из ТиС. Поставил где-то галочку в константах, ответственных за конкретную опцию -- проблема исчезла

(3) Точкой останова остановился Перед записью. Вывел все в таб док, записал, еще раз остановился там же.
Сравнил все что в Объект и Объект.ссылка. Все совпадает

(6) Ну константа бы распространялась бы на все элементы как понимаю. А тут один перезаписал - один появился в справочнике Клиенты.

А посмотри консолью запросов у тебя вообще-то в справочнике контрагенты записи есть? и сколько их там есть? А то может ты их и не перенес вовсе? А просто при перезаписи Партнеры  в силу твоих настроек у тебя создается новый элемент справочника контрагенты. А без перезаписи его просто нет...

(0) при нажатии на эту команду в списке явным образом устанавливается отбор Клиент = Истина, больше никаких чудес там нет. Так что, "Чего то ты, Герасим, не договариваешь" (с) Муму

(7) э...шо ???
зачем 2 раза... ?

1 раз..сразу сравни что в записываем объекте..и что уже в базе (ссылке)...
только сравнивай в самом конце перед записью...
и именно в модуле объекта (а не формы)))

Выдели всех партнеров и перезапиши - делов то