Ставлю в документах в ПКО перед выгрузкой РежимЗаписи = "Проведение";
Чтобы документ проводился и делал движения.

Вопрос собственно как обычно делается, все документы переносятся без признака проведенности и проводятся вручную?

И если оставить такое принудительное проведение, то если возникнет ошибка при проведение загрузка прервется или продолжится?

(0) Прервется, ибо в попытку запихивать надо.
Обычно все документы засовывают в отложенное проведение и проводят после загрузки.

Проведение при ОбменДанными.Загрузка=Истина не фурычит.
Надо насильно отключать в ложь тогда