Поднял флаг "Использовать плановую себестоимость" в настройках пользователя, а все равно приход/расход не двигает рег. себестоимости.

Это зависит от типа реализации(контрагент, договор).

по договорам

попробую апнуть )

Вид договора. С покупателем, комиссионером?

(4) с покупателем