Кто работал с конфигурацией из командной строки?
Выполняю команду:

"C:\Program Files (x86)\1cv8\8.3.6.2299\bin\1cv8c.exe" DESIGNER /F "C:\Users\...\DocumentsБазаДляПодключенияКХранилищу" /ConfigurationRepositoryF "\\...\Depot.IC" /ConfigurationRepositoryN "...." /ConfigurationRepositoryReport "C:\ByComment.xml" -NBegin 930 -NEnd 935 -GroupByComment

Запускается база и все, ничего не происходит, файлы не создаются. Пробовал так же параметр /out "путь к файлу лога" добавлять, не какого лога не создается

добавь /visible

(1) причем тут этот параметр, проблема то в том что файлов нет

Ну не хочешь, не надо.