Подскажите у нас есть пару подразделений находящихся в других районах города. Раньше налоги платили в разные налоговые и сам отчет сдавали в одну налоговую. Теперь нужно сдавать отчеты в разные налоговые. Как это и где разбить и настроить не нашел.

Не поверите,но в подразделениях есть волшебная галочка и туда можно занести реквизиты обособки

(1) Еще как поверю. Благодарю.

(1) Галочка стоит и дальше как и что?

Указал ИНН и КПП у обособленного подразделения? Если мне память не изменяет, нужно перепровести документы-регистраторы из регистра "Расчеты налоговых агентов с бюджетом по НДФЛ", а регистраторы в регистрах "Расчет с бюджетом" и "НДФЛ Сведения о доходах" перепроводятся только если они заполнили поля ОКТМО/ОКАТО/КПП. Если мне память не изменяет.

(4) у нас в этом регистре Расчеты налоговых агентов с бюджетом по НДФЛ вообще нет ни одной записи за текущий период.

А дальше рок-н-рол:)
читаем темы
ЗУП 2.5 и 6-НДФЛ Обсудим "ДатаНачалаУчетаСуммВозврата", '20130101' ?

Про 6-НДФЛ и даты удержания НДФЛ

Елену Грянину находишь лекции и внимательно слушаешь

(8) немного разобрался. Просто у меня опыта именно с ЗуП нулевой. Сейчас перепроведем начисление зп и все заработать должно. Пока отработаем все в тестовой.

У Вас наверное в учетной политике (в настройке ЗУПа) указано "При начислении НДФЛ принимать исчисленный налог к учету как удержанный".

(10) может наоборот?

Даже не напрягаюсь на подумать. Вон, выше, автор собирается перепроводить начисление зарплаты.

(12) если стоит то получаешь сразу движения,если еще нет то может быть не проведена выплата и поэтому еще нет

Не принципиально. Исчисленный - начислением зарплаты (и межрасчетными), удержанный - зарплата к выплате (если упрощенный учет) или кассовыми ордерами, банковскими выписками. Не принципиально.

Вон, прочти (5) - у автора в базе не оформлены документы "Перечисление НДФЛ в бюджет" - и нету "перечисленного". Ему ещё долго быть в "немного разобрался"(9) :))