По договорам учет взаиморасчетов по документам расчетов не ведется. Можно ли в запросе как то извратиться и получить дату последнего неоплаченного документа? Ну то есть например было 3 реализации 2000 01.01.2016, 6000 01.02.2016 и 1000 01.03.2016, была оплата 3000. Конечный долг 6000 тысяч, дату задолженности нужно получить 01.02.2016, так как это последняя неоплаченная реализация.

(0)вопрос на собеседовании?

(1) Нет, вопрос пользователя, который хочет видеть, когда у него образовалась задолженность, но не хочет вести взаиморасчеты по документам расчетов контрагентов.

(0) по регистрам или по бухпроводкам?

(2) денормализуй это - сделай регистр для хранения этой даты. Иначе будет медленно и печально.

А почему последняя 01.02.2016 ?
ведь не сказано за что поступила оплата 3000 .
я так понимаю получается что накладная на 6000 оплачена частично 1000. и по ней остаток 5000 и накладная от 01.03.2016 на сумму 1000 висит.

да. можно. Смотри на ИС пример такого запроса у Ильдаровича

(3) Да как угодно.

(4) Пусть медленно и печально, пользователю сказать - хочешь быстро, ставь галку "вести взаиморасчеты по документам расчетов".

(5) Хоть на копейку реализация будет недооплачена, она должна выводиться.

Вот тут: http://catalog.mista.ru/public/262300/ есть статья "Неоплаченные долги при распределении оплаты по правилу ФИФО одним запросом и намного быстрее, чем Вы думали", где описан запрос, позволяющий решить эту задачу для ваших условий БЫСТРО. Там же приведены ссылки на другие, более простые, но и более медленные решения.

В УПП и КА1.1 есть регистр РасчетыПоРеализацииВУсловныхЕдиницахОрганизации там есть измерение документ

(0) может всё-таки ПЕРВОЙ неоплаченной?
При ФИФО "последняя неоплаченная" = "последняя", если долг есть