Добрый день!
Мне кажется, что НДФЛ исчисленный должен быть равен НДФЛ перечисленному. Но тогда как правильно заполнить документ "Перечисление НДФЛ в бюджет РФ"? У меня сейчас НДФЛ исчисленный в январе стоит перечисленным в феврале (как по факту).

Вам неправильно кажется. Бывает всяко. "НДФЛ исчисленный" это вообще первый этап (при начислении зарплаты), далее следует "НДФЛ удержанный" - это второй этап, при выплате зарплаты, и уже в самом конце - "НДФЛ перечисленный". У каждого этапа свои сроки. Да и нарушение сроков тоже бывает.