Настраиваю из УТ10.3 типовой обмен с БП3.0. Система нигде не спрашивает односторонний нужен обмен или двухсторонний? Похоже по умолчанию делая обмен двухсторонним :-( , можно ли это как-то поменять в типовом варианте?

У тебя система неправильная.
У меня всегда спрашивает

Вот для БП2.0 спрашивала всегда, более того, там можно было даже выбрать конкретные документы, которыми надо было обмениваться, а с БП3.0 - облом - ничего не спрашивает...