Понятно, что можно поставить по ней отбор в дереве конфигурации и удалять руками, но может есть более "правильный" способ?

Можно про каждый объект спрашивать на форуме, например - "А можно я удалю Справочник1?".
И тебе интересно и нам весело!

(0) Думаю, это самый правильный способ

Можна я удалю справочник номенклатура?

(0) скрыть ее из интерфейса и забыть. Быстро и проблем сам себе не создашь.

(0) Удалить серьезную подсистему практически нереально.

(4) +1. Из интерфейса ее выкинь, можешь права отнять, удалить - не факт что взлетит

(1)Ты видно читать не умеешь, где я разрешения у тебя спрашиваю?)

(7) Хорошо, удаляй без разрешения. Если что поломается - я тебя предупреждал!

(8)Если что, я понял кого мне искать)

да, работу в модели сервиса так выпиливал из БСП... сначала все пометить как разрешенное для изменения в поставке, потом вывод по подсистемам и удаление. неудобно, но что делать :(

потому что не надо из демо базы БСП делать самопиську