Добрый день.
Каким образом можно скопировать настройки обработки от одного пользователя другому? Неважно программно или интерактивно.

в регистре сведений оне хранятся, во всех типовых отчетах копируются друг-другу.

если не реализовано - доделай, код возьми с типового отчета, где это реализовано.