Не секрет, что  для расчёта отпускных используются календарные дни. Где в ЗУП 2.5 посмотреть кол-во отработанных календарных дней по сотруднику.

(0) Написать запрос.

Для расчёта отпускных используются не только календарные дни. Это так, к слову.

Для отпускных там наоборот:
количество отработанных календарных дней = "всего календарных дней" - "количество НЕотработанных календарных дней"

(2) Я понимаю, просто в 3.0 эти данные хранятся в РН. В 2.5 похоже они не хранятся, а вычисляются

(3) И в 2.5 хранятся. В регистре ГрафикиРаботыПоВидамВремени, ресурс ПроизводственныйКалендарьКалендарныеДни.

(4) Странный ресурс, туда не попадают дни гос.праздников, хотя при расчёте отпуска они не исключаются из периода.

(5) Действительно, странно. Я раньше не обращал на это внимания.

Погуглите в конфигурации функцию  "ДатаОкончанияОтпускаПоКалендарнымДням".