Подключили сканер в режиме эмуляции COM-порта, дрова поставили. В 1С подключили, но он не добавляет сроки в документ, в чем может быть причина? В обычном режиме штрихкод считывается

В каком обычном режиме? В блокнот считывает что ли?

В списке справочника Номенклатура ищет номенклатуру по штрих-коду?

аутор слился

(2) в режиме эмуляции нет, а так ищет по наименованию
(1) если его вывести из режима эмуляции, то просто считывает текст в любое текстовое поле

почему никто не читает справку?
сбрасывай в заводские, он будет как клавиатура.
заходи в настройку торгового оборудования и настраивай сканер с портом "клавиатура".
вообще этот вопрос раз в неделю стабильно всплывает.

(5) в прочих наших магазинах ничего такого не делали и работает сканер с такими же настройками.

Конфигурация Штрих-М Торговое предприятие

Если сканер не настроить - то он не работает.
А как вы его настроите, как клавиатура или как COM-порт зависит только от того, как вы его подключили.
Суффикс (и если есть префикс) поставить правильно надо.