Соединяю 2 таблицы и пытаюсь выбрать данные с иерархией по номенклатуре.
Пока не использовал "ВЫБОР КОГДА" иерархия работала. Теперь выводится без иерархии.
Почему?

ВЫБРАТЬ
    ВЫБОР
        КОГДА ТоварыНаСкладахОстатки.Номенклатура ЕСТЬ НЕ NULL
            ТОГДА ТоварыНаСкладахОстатки.Номенклатура
        ИНАЧЕ ПродажиОбороты.Номенклатура
    КОНЕЦ КАК Номенклатура,
    ТоварыНаСкладахОстатки.КоличествоОстаток КАК КоличествоОстаток,
    ПродажиОбороты.КоличествоОборот КАК КоличествоОборот
ИЗ
    РегистрНакопления.ТоварыНаСкладах.Остатки КАК ТоварыНаСкладахОстатки
        ПОЛНОЕ СОЕДИНЕНИЕ РегистрНакопления.Продажи.Обороты КАК ПродажиОбороты
        ПО ТоварыНаСкладахОстатки.Номенклатура = ПродажиОбороты.Номенклатура
ИТОГИ
    СУММА(КоличествоОстаток),
    СУММА(КоличествоОборот)
ПО
    ОБЩИЕ,
    Номенклатура

В качестве номенклатуры можно попробовать сам справочник и уже к нему левым соединением остатки и продажи.

(0) Убери итоги по номенклатуре. Зачем они тебе?

Если этот запрос не пример, а реальный запрос на бою, то я сочувствую оптимизатору запросов и конечному пользователю.

(1) тогда вывалится весь справочник да еще и все характеристики (в реальном запросе)
(2) Именно для иерархии и нужно
(3) Запрос - пример

Выбрать
СпрНоменклатура.Ссылка как Номенклатура
Естьnull(Продажи, 0) как Продажи
Естьnull(Остатки, 0) как Остатки

Из Справочник.Номенклатура как СпрНоменклатура
ЛевоеСоединение Продажи по Номенклатура
ЛевоеСоединение Остатки по Номенклатура

ГДЕ НЕ Продажи = 0 ИЛИ НЕ Остатки = 0

Итоги
СУММА(Продажи),
СУММА(Остатки)

По Общие,
Номенклатура Иерархия

ГДЕ НЕ Естьnull(Продажи, 0) = 0 ИЛИ НЕ Естьnull(Остатки, 0)= 0

если непонятно.

(5) Да понятно, что можно.
Думал, есть вариант обойтись без этого, т.к. реальный запрос имеет кучу таблиц и придется долго переписывать только из-за иерархии