...
РезультатЗапроса = Запрос.Выполнить();
Если РезультатЗапроса.Пустой() Тогда
СправочникСписок.Отбор.Ссылка.Использование = Ложь;
СправочникСписок.Отбор.Ссылка.ВидСравнения = ВидСравнения.Равно;
СправочникСписок.Отбор.Ссылка.Значение = Справочники.Номенклатура.ПустаяСсылка();//перестрахуемся
Иначе
СправочникСписок.Отбор.Ссылка.ВидСравнения = ВидСравнения.ВСписке;
СправочникСписок.Отбор.Ссылка.Значение.ЗагрузитьЗначения(РезультатЗапроса.Выгрузить().ВыгрузитьКолонку("Номенклатура"));
СправочникСписок.Отбор.Ссылка.Использование = Истина;
КонецЕсли;
Нужно по отдельному списку значений делать отбор. Добавляю первый элемент - отбор корректно накладывается, форма отрисовывает 4 элемента номенклатуры. Далее добавляю ещё одно значение отбора, отбор устанавливается корректно (уже меньше подходящих значений, 3) - а форма всё ещё отображает 4 элемента. Если вручную зайти в отбор и например поставить "Комментарий НеРавно "впваыилвдппфжвадпо", то форма отрефрешится верно на 3 элемента.