В запросе из регистра группировка первого уровня - номенклатура, второго уровня - месяц. Так вот, в строках с элементами в месяцах значения есть, а в группах справочника только на первом уровне группировки, а в месяцах ничего.
    |Товар = Регистр.ОстаткиТоваров.Товар;
    |ОстатокТовара = Регистр.ОстаткиТоваров.ОстатокТовара;
    |ПродСумма = Регистр.ОстаткиТоваров.ПродСумма;
    |ТипОперации = Регистр.ОстаткиТоваров.ТипОперации;
    |Функция ОстатокТовараРасход = Расход(ОстатокТовара);
    |Функция ПродСуммаРасход = Расход(ПродСумма);
    |Условие(Товар в СпТоваров);
    |Группировка Товар;
    |Группировка Месяц Все ВошедшиеВЗапрос;";

Так остатки выдаются только на дату, по периоду нет возможности вывести

(0) Насколько помню была такая фигня с периодами и группами.
Попробуй группировки местами поменять - сначала Месяц, потом товар.
Если поможет - выводи сначала в ТЗ, потом при выводе на печать "переворачивай".

можнов ИТЗ вывести, и сгруппировать как надо

(3) не, не поможет. такой группировки как надо ТС не будет в ИТЗ

(4) может я не совсем понял, что ему нужно...

ЗначениеУпорядочивания

или НачалоПериода... не помню уже

(5)
Чорный запрос и ИТЗ.Группировать(Товар:Товар&;Месяц:Месяц) дают такое:

Группа0
  Группа1
    Товар1
      Месяц1
      Месяц2
Группа0
  Товар2
    Месяц1
    Месяц2

а ТС надо:

Группа0
      Месяц1
      Месяц2
  Группа1
      Месяц1
      Месяц2
    Товар1
      Месяц1
      Месяц2
Группа0
    Месяц1
    Месяц2
  Товар2
    Месяц1
    Месяц2

Просветите, плиз, что такое ИТЗ, а то я отстал.
Есть способ решить это перебором ТЗ для суммирования недостающих группировок, но это грубо. А запросом никак.

ИТЗ - ИндексированнаяТаблица из 1с++
http://www.1cpp.ru/docum/html/IndexedTable.html

(9) Ты метод из (2) проверил?

(2) Ну да, просто итз.Группировать не подойдет при такой постановке задачи.
Это фактически кросс таблица. Но решается не сильно сложно. Как то вот так:

    |Функция КоличествоРасход = Расход(Количество);
    |Функция КоличествоПриход = Приход(Количество);
    |Группировка Товар без групп;
    |Группировка Месяц все;
    |";
    
    Запрос=СоздатьОбъект("Запрос");
    Запрос.Выполнить(ТекстЗапроса);
    
    итз=СоздатьОбъект("ИндексированнаяТаблица");
    итз.ЗагрузитьЗапрос(Запрос);

    СписокРесурсов=СоздатьОбъект("СписокЗначений");
    СписокРесурсов.ДобавитьЗначение("КоличествоРасход");
    СписокРесурсов.ДобавитьЗначение("КоличествоПриход");
    
    СписокМесяцев=СоздатьОбъект("СписокЗначений");
    СтрокиСумм="";
    итз.ДобавитьИндекс("Месяц","*Месяц");
    итз.Выгрузить(СписокМесяцев,"Месяц","Месяц",1);
    
    Для ии1=1 По СписокРесурсов.РазмерСписка() Цикл
        ИмяРесурса=СписокРесурсов.ПолучитьЗначение(ии1);
        Для ии2=1 По СписокМесяцев.РазмерСписка() Цикл
            Месяц=СписокМесяцев.ПолучитьЗначение(ии2);
            ИмяКолонки=ИмяРесурса+Месяц;
            итз.НоваяКолонка(ИмяКолонки);
            СтрокиСумм=СтрокиСумм+?(СтрокиСумм="","",",")+ИмяКолонки;
            итз.УстановитьФильтр(Месяц,Месяц,"Месяц");
            итз.ЗаполнитьКолонку("Месяц",ИмяКолонки,итз,"Месяц",ИмяРесурса);
        КонецЦикла;
    КонецЦикла;
    итз.Группировать("Товар:Товар&",СтрокиСумм,1);


+(12) не (2), а (8)

(11) Вроде подбирает. Но обход не в том порядке. В общем, давить задачу массой кода тем или иным способом. Всем спасибо.